Initialising ...
Initialising ...
Initialising ...
Initialising ...
Initialising ...
Initialising ...
Initialising ...
, isolated from freshwater fish in Japan佐藤 勝也; 小野寺 威文*; 面曽 宏太*; 武田-矢野 喜代子*; 片山 豪*; 大野 豊; 鳴海 一成*
Genome Announcements (Internet), 4(1), p.e01631-15_1 - e01631-15_2, 2016/01
was isolated as a gram-negative, red-pigmented, radioresistant, rod-shaped bacterium from freshwater fish. The draft genome sequence of 
ATCC 43672 was 4,092,497 bp, with an average G+C content of 67.5% and comprised of 4 circular contigs and 3 linear contigs that was deposited at DDBJ/EMBL/Genbank under the accession number BCMS00000000. The draft genome sequence indicates that possesses a DNA damage response regulator (encoded by 
homolog) and radiation-desiccation response regulons (
, 
, 
, 
and 
homologs etc.), which are involved in the unique radiation-desiccation response system in 
. As it is for , seems to employ the same radioresistant mechanisms. In future, the draft genome sequence of will be useful for elucidating the common principles of the radioresistance based on the extremely efficient DNA repair mechanisms in Deinococcus species by the comparative analysis of genomic sequences.
の転写応答に関わる新規遺伝子
の機能解析金子 匠*; 佐藤 勝也; 鳴海 一成*
no journal, ,
放射線抵抗性細菌
のDR0171タンパク質は、高線量の放射線照射後に発現が増加する機能未知タンパク質である。における遺伝子破壊解析において、遺伝子破壊株の各種変異原に対する感受性が野生株に比べて高いことから、
遺伝子はDNA修復に関与していると示唆されている。また、遺伝子破壊によって、他の多数の遺伝子群の発現が変化したことから、は何らかの転写応答に関わっていると考えられている。しかし、遺伝子の機能については不明な点が多い。一方、ドラフトゲノム解析の結果から、には、の相同遺伝子(
)が存在することが分かっている。そこで、本研究では、の遺伝子破壊株を作製し、遺伝子の機能解析を行った。
の放射線誘導性
遺伝子の機能解析池上 和貴*; 佐藤 勝也; 鳴海 一成*
no journal, ,
放射性抵抗性細菌は、他の生物にとって致死効果を示す電離放射線やUVに対して極めて耐性を持つ。のマイクロアレイ解析から、放射線照射後、最も高く発現上昇する遺伝子の一つとして遺伝子が知られている。DdrBタンパク質は、一本鎖DNA結合タンパク質であるが、これまでに構造解析されている他のすべての一本鎖結合タンパク質とは異なり、特徴的な構造を持つ。ドラフトゲノム解析から、のゲノムには、遺伝子が1コピー存在することが分かっている。しかし、その機能については、ほとんど明らかにされていない。そこで、の遺伝子破壊株を作製し、における遺伝子の役割や機能について解析を行った。
における突然変異を誘発する遺伝子の破壊株作製および突然変異頻度解析面曽 宏太*; 佐藤 勝也; 鳴海 一成*
no journal, ,
放射線抵抗性細菌には、DNAポリメラーゼの
サブユニットをコードする
(
)遺伝子に相同性のある遺伝子が2つ存在する(
および
)。一般的に相同遺伝子は、突然変異を誘発する機能をもつことが示唆されている。しかし、放射線抵抗性細菌における相同遺伝子の機能についてはよく分かっていない。そこで、本研究ではおよび遺伝子が突然変異誘発に関わっているのかどうか、あるいは役割分担があるのかどうか、遺伝子破壊株を作製し、分子遺伝学的解析を行った。
における突然変異を誘発する遺伝子の機能解析面曽 宏太*; 佐藤 勝也; 鳴海 一成*
no journal, ,
放射線抵抗性細菌には、DNAポリメラーゼのサブユニットをコードする()遺伝子に相同性のある遺伝子が2つ存在する(および)。相同遺伝子は、突然変異を誘発する機能をもつことが示唆されている。しかし、放射線抵抗性細菌における相同遺伝子の機能についてはよく分かっていない。そこで、本研究ではおよび遺伝子が突然変異誘発に関わっているのかどうか、あるいは役割分担があるのかどうか、遺伝子破壊株を作製し、分子遺伝学的解析を行った。
の機能解析黒澤 飛翔*; 佐藤 勝也; 鳴海 一成*
no journal, ,
属細菌は、放射線, UV, アルキル化剤, 酸化剤, 乾燥等で誘発される様々なDNA損傷に対する修復能力を有している。を用いたこれまでの研究で、DNA修復を促進する多面的タンパク質PprA (pleiotropic protein promoting DNA repair)とDNA修復時における遺伝子の発現誘導を活性化する制御タンパク質PprI (inducer of PprA)が発見されている。本研究は、PprIタンパク質に着目し、属細菌のDNA修復機構の共通原理を見出すことを目的とした。及びの遺伝子破壊株を作製し、紫外線, マイトマイシンC, ブレオマイシン, 過酸化水素, ナリジクス酸に対する感受性を野生株と比較した。
の機能解析黒澤 飛翔*; 佐藤 勝也; 鳴海 一成*
no journal, ,
属細菌は、放射線、UV、アルキル化剤、酸化剤、乾燥等で誘発される様々なDNA損傷に対する修復能力を有している。を用いたこれまでの研究で、DNA修復を促進する多面的タンパク質PprA (pleiotropic protein promoting DNA repair)とDNA修復時における遺伝子の発現誘導を活性化する制御タンパク質PprI (inducer of PprA)が発見されている。本研究は、PprIタンパク質に着目し、属細菌のDNA修復機構の共通原理を見出すことを目的とした。及びの遺伝子破壊株を作製し、DNA変異原に対する感受性を野生株と比較した。
遺伝子破壊株は、
遺伝子破壊株と同様に、
線, 紫外線, MMCに対して野生株よりも感受性を示した。これに加えて、遺伝子破壊株は、ブレオマイシンと過酸化水素にも感受性を示した。これらのことから、PprIタンパク質は両菌種において、DNAに誘発された鎖切断, 酸化損傷, ピリミジンダイマー, アルキル化及び鎖間架橋の修復に関わっていると考えられた。
における突然変異を誘発する遺伝子の機能解析面曽 宏太*; 佐藤 勝也; 鳴海 一成*
no journal, ,
放射線抵抗性細菌には、複製型DNAポリメラーゼのサブユニットをコードする遺伝子に相同性のある遺伝子が2つ存在する(
および
)。相同遺伝子は、突然変異を誘発する機能をもつことが示唆されている。しかし、放射線抵抗性細菌における相同遺伝子の機能についてはよく分かっていない。そこで、本研究ではおよび遺伝子が突然変異誘発に関わっているのかどうか、あるいは役割分担があるのかどうか、遺伝子破壊株を作製し、分子遺伝学的解析を行った。その結果、2つの遺伝子は紫外線照射後の突然変異誘発に大きく関わっていることが示唆された。さらに、遺伝子過剰発現株では、紫外線照射前後で、野生株よりも突然変異率の上昇が見られたことから、遺伝子は突然変異誘発遺伝子として機能することが明らかになった。
